在三江并流的这片高原上，自西而东散落着8个自然保护区：高黎贡山自然保护区东临怒江，南北走向的高山大川中形成明显的生物和气候垂直带谱，发育着丰富的动、植物种群。1986年7月被国务院批准为国家级自然保护区。其森林垂直景观以亚热带常绿阔叶林为基础植被，其中高等植物有150余科，500余属、1000余种，珍稀植物有楠木、桢楠、大树杜鹃、云南红豆杉、香樟、杜仲、厚朴等。保护区的动物有140余种，鸟类近300种，有“哺乳动物祖先分化的发源地”、“云南雉鹊的乐园”、“南北动物的走廊”和“第四纪冰川活动时期原生动物的避难所”之誉。

　　怒江自然保护区位于横断山脉西部。1986年3月被云南列为省级自然保护区，是目前我国山地生态系统保存比较完整，结构功能相对稳定，较原始的自然地理景观。19世纪以来，中外学者涉足其间，考察这里最引入注目的原始阔叶林区，珍稀濒危植物有桫椤、秃杉和董棕等。保护区内的动物有羚牛、赤斑羚、小熊猫、血雉、黑麝等。