滇池水污染治理通过多年的努力，在滇池流域经济快速增长，人口不断增加的情况下，滇池水体水质总体保持稳定，主要污染物稳中有降，基本遏制住了滇池水质恶化的势头。

1986 年前，滇池水质还是三类水，按国家标准可做饮用水水源。此后，滇池水质量富营养化，不再符合饮用水源标准。1994 年后，成为五类水，仅可作为农业用水，1998 年至 2000 年，连续三年是超五类水，几乎失去了作为水的各种功能，成为一池废水。1999 年、2000 年爆发蓝藻，被生态学家诊断为“患上了生态癌”。据环保部门调查，滇池水体中的总磷、总氮、化学需氧量及有互有害物质等重要污染物的超标率，低的为 50%，高的达 80 倍之多。而草海（滇池的内湖）中的致癌、致突变、致畸形的物质高达 60 种。滇池成为我国重点治理的“三大湖泊”之首。